Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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TCRBV7S3A2A0A539 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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TCRBV7S3A2A0A539 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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TCRBV7S3A2A0A539 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TCRBV7S3A2A0A539 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV7S3A2A0A539 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TCRBV7S3A2A0A539 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TCRBV7S3A2A0A539 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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