Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PF4P02776 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PF4P02776 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PF4P02776 C10orf82-201ENST00000369210 994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PF4P02776 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PF4P02776 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PF4P02776 AC007601.1-201ENST00000312019 1974 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 PIGN-226ENST00000638591 2776 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PF4P02776 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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