Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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