Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ADCY4-201ENST00000310677 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SPOCK3Q9BQ16 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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