Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD1Q99460 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms