Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms