Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULJ8

PPP1R9A, Neurabin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9AQ9ULJ8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R9AQ9ULJ8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R9AQ9ULJ8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R9AQ9ULJ8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R9AQ9ULJ8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R9AQ9ULJ8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R9AQ9ULJ8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R9AQ9ULJ8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R9AQ9ULJ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R9AQ9ULJ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R9AQ9ULJ8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R9AQ9ULJ8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms