Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms