Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED11Q9P086 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED11Q9P086 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.2 ms