Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-8■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 LINC01237-202ENST00000429947 470 ntTSL 412.99□□□□□ -0.332e-7■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 HYOU1-207ENST00000530473 2023 ntTSL 512.83□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-8■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-8■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.472e-8■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 HDGFL2-202ENST00000589486 805 ntTSL 511.99□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.492e-8■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 DENND4A-207ENST00000567323 804 ntTSL 28.09□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.232e-7■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.067e-7■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 TPCN2-207ENST00000637084 4622 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 24.9
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-204ENST00000562226 1088 ntTSL 219.47■□□□□ 0.715e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.75e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.585e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-213ENST00000568964 853 ntTSL 217.9■□□□□ 0.465e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-210ENST00000567595 663 ntTSL 316.84■□□□□ 0.295e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.095e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-215ENST00000570014 882 ntTSL 515.54■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-209ENST00000566627 694 ntTSL 315.37■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-203ENST00000545827 2731 ntTSL 215.25■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-205ENST00000562380 551 ntTSL 44.13□□□□□ -1.755e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.87e-9■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.547e-9■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.467e-9■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.351e-9■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-9■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.111e-9■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 AKIRIN1-204ENST00000531822 718 ntTSL 58.87□□□□□ -0.991e-9■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SIN3A-212ENST00000568919 455 ntTSL 217.03■□□□□ 0.322e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SIN3A-206ENST00000565264 510 ntTSL 415.46■□□□□ 0.072e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SLC50A1-211ENST00000490276 778 ntTSL 318.2■□□□□ 0.54e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 ADAP1-215ENST00000495809 2236 ntTSL 217.74■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SLC50A1-204ENST00000368405 1003 ntTSL 211.04□□□□□ -0.644e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PLCXD1-209ENST00000447472 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 413.72□□□□□ -0.216e-16■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PLCXD1-204ENST00000415337 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.39□□□□□ -0.276e-16■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PLCXD1-210ENST00000448477 828 ntTSL 213.13□□□□□ -0.316e-16■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 215.79■□□□□ 0.124e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.692e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.632e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.582e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-212ENST00000532978 2489 ntTSL 216.25■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-205ENST00000392483 581 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.092e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TPD52L1-215ENST00000534368 684 ntTSL 36.72□□□□□ -1.332e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.462e-8■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-8■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 TMEM74B-202ENST00000429036 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.65□□□□□ -0.063e-8■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.67□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PKP3-206ENST00000528036 940 ntTSL 221.82■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PKP3-210ENST00000533249 1111 ntTSL 321.69■■□□□ 1.061e-6■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PKP3-211ENST00000534401 756 ntTSL 319.85■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PKP3-205ENST00000527442 847 ntTSL 319.59■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.612e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.414e-8■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PKP3-208ENST00000531857 687 ntTSL 416.47■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PKP3-209ENST00000533069 590 ntTSL 215.62■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 510.37□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.445e-9■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 CTIF-206ENST00000588345 584 ntTSL 317.25■□□□□ 0.353e-7■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-209ENST00000484527 833 ntTSL 312.32□□□□□ -0.447e-10■■■■□ 24.8
CSTF2TQ9H0L4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.61e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 RGS20-210ENST00000523414 668 ntTSL 216.39■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.181e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 RGS20-206ENST00000518286 455 ntTSL 313.56□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 RGS20-209ENST00000523280 1434 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.431e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 RGS20-205ENST00000517659 1518 ntTSL 1 (best)5.71□□□□□ -1.51e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 SBF1-203ENST00000399627 811 ntTSL 516.83■□□□□ 0.282e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 NXN-209ENST00000575455 914 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 NXN-212ENST00000577098 659 ntTSL 312.49□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 NXN-205ENST00000571338 586 ntTSL 48.11□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF394-204ENST00000462024 528 ntTSL 310.59□□□□□ -0.719e-13■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 318.35■□□□□ 0.534e-8■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 SPART-210ENST00000494703 796 ntTSL 216.62■□□□□ 0.257e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.227e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.527e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.647e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.423e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 UBTF-214ENST00000537550 1085 ntTSL 222.33■■□□□ 1.173e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.663e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.573e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL1-202ENST00000517668 665 ntTSL 518.13■□□□□ 0.494e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 MYO5C-202ENST00000541028 999 ntTSL 215.52■□□□□ 0.083e-7■■■■□ 24.7
CSTF2TQ9H0L4 MYO5C-204ENST00000558479 770 ntTSL 314.59□□□□□ -0.073e-7■■■■□ 24.7
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