Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CELF4Q9BZC1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms