Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SETD2Q9BYW2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SETD2Q9BYW2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SETD2Q9BYW2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms