Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB6Q9BUF5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB6Q9BUF5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms