Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
OPTNQ96CV9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms