Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00528Q8N1L1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms