Protein–RNA interactions for Protein: Q8N129

CNPY4, Protein canopy homolog 4, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY4Q8N129 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY4Q8N129 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY4Q8N129 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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