Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H1FOOQ8IZA3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H1FOOQ8IZA3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms