Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms