Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms