Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CD109Q6YHK3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CD109Q6YHK3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CD109Q6YHK3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms