Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLC3Q6P597 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLC3Q6P597 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms