Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPRNQ4KMQ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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