Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC27Q2M243 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC27Q2M243 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC27Q2M243 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms