Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ZKSCAN1-204ENST00000482979 1449 ntTSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.193e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.433e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.753e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.953e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ZKSCAN1-203ENST00000432317 573 ntTSL 47.95□□□□□ -1.143e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NKAP-203ENST00000477789 2345 ntTSL 26.77□□□□□ -1.331e-6■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 EIF3D-209ENST00000462641 887 ntTSL 212.2□□□□□ -0.463e-6■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.441e-6■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 IK-208ENST00000515015 493 ntTSL 28.35□□□□□ -1.071e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 GTF2I-217ENST00000620631 868 ntTSL 27.23□□□□□ -1.255e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 MCM4-209ENST00000520637 839 ntTSL 211.95□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 518.78■□□□□ 0.64e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.324e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ZC3H4-205ENST00000601973 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.73□□□□□ -0.054e-7■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 CCDC174-201ENST00000303688 2714 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.677e-7■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 CCDC174-206ENST00000611584 2720 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.817e-7■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 CCDC174-202ENST00000383794 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.037e-7■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 222.29■■□□□ 1.162e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.12e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ATP5A1-208ENST00000589252 662 ntTSL 520.42■□□□□ 0.862e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ATP5A1-210ENST00000589869 910 ntTSL 316.18■□□□□ 0.182e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ATP5A1-218ENST00000592364 576 ntTSL 514.62□□□□□ -0.072e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.162e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RNF220-210ENST00000474394 810 ntTSL 311.49□□□□□ -0.574e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.452e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.322e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.222e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.172e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.052e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.052e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 POLR2F-212ENST00000492213 550 ntTSL 421.58■■□□□ 1.052e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.982e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 POLR2F-206ENST00000443002 1890 ntTSL 221.05■□□□□ 0.962e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-204ENST00000522282 445 ntTSL 320.99■□□□□ 0.952e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-206ENST00000612880 593 ntTSL 220.99■□□□□ 0.952e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.782e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.422e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RNF10-224ENST00000546262 776 ntTSL 417.62■□□□□ 0.412e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.362e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-203ENST00000519428 676 ntTSL 216.9■□□□□ 0.32e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.172e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.152e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RNF10-204ENST00000535395 414 ntTSL 215.94■□□□□ 0.142e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 BNIP3-203ENST00000631806 752 ntTSL 215.37■□□□□ 0.052e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 POLR2F-209ENST00000483713 615 ntTSL 315.05■□□□□ -02e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 POLR2F-210ENST00000484894 551 ntTSL 414.11□□□□□ -0.152e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RNF10-214ENST00000540046 635 ntTSL 313.51□□□□□ -0.252e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-208ENST00000615676 5092 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.272e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.292e-10■■■□□ 15.1
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PUM1Q14671 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-10■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 DHX38-203ENST00000563650 1123 ntTSL 312.46□□□□□ -0.416e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 ETFB-204ENST00000594361 2843 nt11.6□□□□□ -0.552e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.612e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RNF10-221ENST00000544124 448 ntTSL 29.88□□□□□ -0.832e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RNF10-223ENST00000545419 1336 ntTSL 58.02□□□□□ -1.132e-9■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.728e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.38e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.168e-8■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.374e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.664e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.338e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 EP400-202ENST00000332482 2588 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.982e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -12e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.93e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.793e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.333e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.455e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.475e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.525e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 RSRP1-208ENST00000561867 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.49■□□□□ 0.551e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 RSRP1-219ENST00000568701 629 ntAPPRIS ALT2 TSL 418.49■□□□□ 0.551e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 RSRP1-220ENST00000568996 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.96■□□□□ 0.311e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 RSRP1-216ENST00000568212 570 ntTSL 415.26■□□□□ 0.031e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 RSRP1-217ENST00000568254 2013 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.091e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 213.34□□□□□ -0.271e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 RSRP1-207ENST00000498238 2941 ntTSL 211.91□□□□□ -0.51e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 SLC39A7-204ENST00000463972 1410 ntTSL 212.54□□□□□ -0.43e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.516e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.416e-7■■■□□ 15
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