Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H3Q13889 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H3Q13889 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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