Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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TUBA3CQ13748 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TUBA3CQ13748 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBA3CQ13748 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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