Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP3Q12983 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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