Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF4Q08170 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms