Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX16P57768 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX16P57768 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX16P57768 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX16P57768 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX16P57768 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX16P57768 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX16P57768 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX16P57768 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX16P57768 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX16P57768 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX16P57768 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX16P57768 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX16P57768 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX16P57768 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX16P57768 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX16P57768 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX16P57768 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX16P57768 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX16P57768 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX16P57768 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX16P57768 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX16P57768 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX16P57768 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX16P57768 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX16P57768 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX16P57768 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX16P57768 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX16P57768 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX16P57768 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX16P57768 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX16P57768 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX16P57768 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX16P57768 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX16P57768 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX16P57768 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX16P57768 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX16P57768 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX16P57768 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX16P57768 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX16P57768 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX16P57768 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX16P57768 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms