Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF10P55107 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF10P55107 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF10P55107 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF10P55107 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF10P55107 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF10P55107 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF10P55107 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF10P55107 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF10P55107 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF10P55107 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF10P55107 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF10P55107 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF10P55107 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF10P55107 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF10P55107 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF10P55107 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF10P55107 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF10P55107 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF10P55107 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF10P55107 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF10P55107 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF10P55107 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF10P55107 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF10P55107 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF10P55107 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF10P55107 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF10P55107 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF10P55107 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF10P55107 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF10P55107 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF10P55107 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF10P55107 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF10P55107 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF10P55107 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF10P55107 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms