Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	MRM1	YOR201C	1239 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	TCO89	YPL180W	2400 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	PUT2	YHR037W	1728 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	LDB17	YDL146W	1476 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	CHD1	YER164W	4407 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	SUL2	YLR092W	2682 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	HCM1	YCR065W	1695 nt		3.65	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	MLF3	YNL074C	1359 nt		3.65	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	MEF2	YJL102W	2460 nt		3.65	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	SSH4	YKL124W	1740 nt		3.65	□□□□□ -1.82
SHE2	P36068	FRA2	YGL220W	363 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	MTF1	YMR228W	1026 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	OCA1	YNL099C	717 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RPL18B	YNL301C	561 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RPS19A	YOL121C	435 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	MGR2	YPL098C	342 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YPR071W	YPR071W	636 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	PZF1	YPR186C	1290 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	PIM1	YBL022C	3402 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	TRM11	YOL124C	1302 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	TRK1	YJL129C	3708 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	HIS6	YIL020C	786 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	MAC1	YMR021C	1254 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	DPH6	YLR143W	2058 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	LPP1	YDR503C	825 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	COX4	YGL187C	468 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	SAE3	YHR079C-A	276 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	IRC9	YJL142C	393 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	MHO1	YJR008W	1017 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YRA2	YKL214C	612 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YNL228W	YNL228W	777 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	URE2	YNL229C	1065 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	CUS2	YNL286W	858 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RRP40	YOL142W	723 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	MTR10	YOR160W	2919 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RPP1A	YDL081C	321 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RRP45	YDR280W	918 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RFC2	YJR068W	1062 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	AAD10	YJR155W	867 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YLR374C	YLR374C	390 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	SAT4	YCR008W	1812 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RPO21	YDL140C	5202 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	HMG1	YML075C	3165 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	BIK1	YCL029C	1323 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	ALG9	YNL219C	1668 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RCM1	YNL022C	1473 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RAM1	YDL090C	1296 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YER076C	YER076C	909 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	IDI1	YPL117C	867 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	ZRC1	YMR243C	1329 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	MRE11	YMR224C	2079 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	SPC105	YGL093W	2754 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	IDS2	YJL146W	1410 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	CYC1	YJR048W	330 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YPL278C	YPL278C	303 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	snR3	snR3	194 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	PRP40	YKL012W	1752 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	RSC3	YDR303C	2658 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	GRS2	YPR081C	1857 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YER034W	YER034W	558 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YBR016W	YBR016W	387 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	YOR379C	YOR379C	339 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	CEG1	YGL130W	1380 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SHE2	P36068	ERG4	YGL012W	1422 nt		3.59	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	TDA6	YPR157W	1404 nt		3.59	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.59	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	RPS13	YDR064W	456 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	YGL108C	YGL108C	423 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	REC104	YHR157W	549 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	OAR1	YKL055C	837 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	YAL056C-A	YAL056C-A	351 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	ADD66	YKL206C	804 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	ASC1	YMR116C	960 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	YOR292C	YOR292C	930 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	DSS4	YPR017C	432 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	FMP30	YPL103C	1407 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	RSC58	YLR033W	1509 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	YEH2	YLR020C	1617 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	LYP1	YNL268W	1836 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	ADY3	YDL239C	2373 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	GAC1	YOR178C	2382 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	BCK2	YER167W	2556 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	RTA1	YGR213C	954 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	GTR1	YML121W	933 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	CCS1	YMR038C	750 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	YPT53	YNL093W	663 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	MED4	YOR174W	855 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	RDH54	YBR073W	2877 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	YER077C	YER077C	2067 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	IXR1	YKL032C	1794 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	VPS45	YGL095C	1734 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	MSK1	YNL073W	1731 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	YGL088W	YGL088W	366 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	SRP40	YKR092C	1221 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SHE2	P36068	ATG33	YLR356W	594 nt		3.56	□□□□□ -1.84

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