RNA–Protein interactions for RNA: YAL056C-A

YAL056C-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YAL056C-A, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAL056C-AYAL056C-A FAP1P53971 965 aa12.36□□□□□ -0.43
YAL056C-AYAL056C-A MON2P48563 1636 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
YAL056C-AYAL056C-A INO80P53115 1489 aa11.89□□□□□ -0.51
YAL056C-AYAL056C-A PRY3P47033 881 aa11.76□□□□□ -0.53
YAL056C-AYAL056C-A DNA2P38859 1522 aa11.37□□□□□ -0.59
YAL056C-AYAL056C-A YCK3P39962 524 aa11.28□□□□□ -0.6
YAL056C-AYAL056C-A MTC1P47018 478 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
YAL056C-AYAL056C-A SWR1Q05471 1514 aa11.2□□□□□ -0.62
YAL056C-AYAL056C-A RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
YAL056C-AYAL056C-A KOG1P38873 1557 aa11.09□□□□□ -0.63
YAL056C-AYAL056C-A HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-DR4Q07793 1604 aa10.93□□□□□ -0.66
YAL056C-AYAL056C-A AAD16Q02895 342 aa10.86□□□□□ -0.67
YAL056C-AYAL056C-A TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
YAL056C-AYAL056C-A PRI1P10363 409 aa10.7□□□□□ -0.7
YAL056C-AYAL056C-A SPA2P23201 1466 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
YAL056C-AYAL056C-A HSL1P34244 1518 aa10.47□□□□□ -0.73
YAL056C-AYAL056C-A SPT6P23615 1451 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
YAL056C-AYAL056C-A SGS1P35187 1447 aa10.42□□□□□ -0.74
YAL056C-AYAL056C-A ECM5Q03214 1411 aa10.39□□□□□ -0.75
YAL056C-AYAL056C-A BUD4P47136 1447 aa10.22□□□□□ -0.77
YAL056C-AYAL056C-A THO2P53552 1597 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
YAL056C-AYAL056C-A HIR3P47171 1648 aa10.22□□□□□ -0.77
YAL056C-AYAL056C-A MDS3P53094 1487 aa10.21□□□□□ -0.78
YAL056C-AYAL056C-A REV3P14284 1504 aa10.09□□□□□ -0.79
YAL056C-AYAL056C-A PEP1P32319 1579 aa10.05□□□□□ -0.8
YAL056C-AYAL056C-A BPT1P14772 1559 aa9.97□□□□□ -0.81
YAL056C-AYAL056C-A BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
YAL056C-AYAL056C-A XRN1P22147 1528 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
YAL056C-AYAL056C-A ATG2P53855 1592 aa9.94□□□□□ -0.82
YAL056C-AYAL056C-A TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
YAL056C-AYAL056C-A MIF2P35201 549 aa9.78□□□□□ -0.84
YAL056C-AYAL056C-A YCF1P39109 1515 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
YAL056C-AYAL056C-A YGL015CP33199 130 aa9.75□□□□□ -0.85
YAL056C-AYAL056C-A ISW2Q08773 1120 aa9.71□□□□□ -0.86
YAL056C-AYAL056C-A SKI3P17883 1432 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
YAL056C-AYAL056C-A TAF2P23255 1407 aa9.71□□□□□ -0.86
YAL056C-AYAL056C-A RPG1P38249 964 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
YAL056C-AYAL056C-A SSK2P53599 1579 aa9.66□□□□□ -0.86
YAL056C-AYAL056C-A DRS1P32892 752 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
YAL056C-AYAL056C-A SIN3P22579 1536 aa9.55□□□□□ -0.88
YAL056C-AYAL056C-A UFD4P33202 1483 aa9.54□□□□□ -0.88
YAL056C-AYAL056C-A ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
YAL056C-AYAL056C-A MYO2P19524 1574 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
YAL056C-AYAL056C-A MRPL32P25348 183 aa9.52□□□□□ -0.89
YAL056C-AYAL056C-A ESP1Q03018 1630 aa9.52□□□□□ -0.89
YAL056C-AYAL056C-A DNF1P32660 1571 aa9.51□□□□□ -0.89
YAL056C-AYAL056C-A BNI1P41832 1953 aa9.5□□□□□ -0.89
YAL056C-AYAL056C-A CDC25P04821 1589 aa9.49□□□□□ -0.89
YAL056C-AYAL056C-A YFR006WP43590 535 aa9.48□□□□□ -0.89
YAL056C-AYAL056C-A RPA190P10964 1664 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A MET5P47169 1442 aa9.45□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A LTE1P07866 1435 aa9.43□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A SCC2Q04002 1493 aa9.41□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-BRQ12193 1756 aa9.41□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-GR3Q12316 1755 aa9.41□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-ORQ92393 1755 aa9.41□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A CHD1P32657 1468 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A SSN2P38931 1420 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-FP0CX63 1770 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-GR2P0CX64 1770 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-CP25384 1770 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-DR2Q03494 1770 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-DR1Q03855 1755 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-OR1Q12113 1770 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-DR1Q12472 1770 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-OR2Q12501 1770 aa9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
YAL056C-AYAL056C-A RKR1Q04781 1562 aa9.39□□□□□ -0.91
YAL056C-AYAL056C-A RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
YAL056C-AYAL056C-A ITT1Q04638 464 aa9.38□□□□□ -0.91
YAL056C-AYAL056C-A YPK9Q12697 1472 aa9.33□□□□□ -0.92
YAL056C-AYAL056C-A RPO31P04051 1460 aa9.3□□□□□ -0.92
YAL056C-AYAL056C-A PAN1P32521 1480 aa9.3□□□□□ -0.92
YAL056C-AYAL056C-A GEA2P39993 1459 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
YAL056C-AYAL056C-A MMS1Q06211 1407 aa9.28□□□□□ -0.92
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-HO13535 1793 aa9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-JR1P47098 1755 aa9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-ER1Q03612 1755 aa9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-GR2Q12269 1755 aa9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-OLQ12273 1755 aa9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A IRC20Q06554 1556 aa9.26□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY2B-BQ12491 1770 aa9.26□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A YRF1-1P0CX20 1796 aa9.22□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A YRF1-5P0CX21 1796 aa9.22□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A YRF1-8P0CX22 1796 aa9.22□□□□□ -0.93
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-DR3Q99231 1755 aa9.21□□□□□ -0.94
YAL056C-AYAL056C-A SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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