Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP5DP30049 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5DP30049 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms