Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPH2P23942 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPH2P23942 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPH2P23942 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPH2P23942 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPH2P23942 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPH2P23942 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPH2P23942 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPH2P23942 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPH2P23942 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPH2P23942 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPH2P23942 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPH2P23942 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPH2P23942 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPH2P23942 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPH2P23942 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPH2P23942 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPH2P23942 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPH2P23942 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPH2P23942 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms