Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRR29P0C7W0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR29P0C7W0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms