Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PPFIA3O75145 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms