Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG3O60359 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG3O60359 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms