Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNAB3O43448 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNAB3O43448 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms