Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F3O00716 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F3O00716 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F3O00716 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F3O00716 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F3O00716 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F3O00716 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F3O00716 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F3O00716 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F3O00716 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F3O00716 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F3O00716 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F3O00716 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F3O00716 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F3O00716 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F3O00716 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F3O00716 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F3O00716 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F3O00716 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F3O00716 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F3O00716 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F3O00716 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F3O00716 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F3O00716 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F3O00716 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F3O00716 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F3O00716 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F3O00716 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F3O00716 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F3O00716 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F3O00716 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F3O00716 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2F3O00716 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2F3O00716 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms