Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS1O00470 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms