Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms