Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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