Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms