Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PF4P02776 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PF4P02776 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PF4P02776 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PF4P02776 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PF4P02776 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PF4P02776 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 MPP4-207ENST00000428900 2320 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PF4P02776 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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