Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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