Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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