Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALD1Q05682 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms