Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRTQ9BXP5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms