Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms