Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTCH1Q13635 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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